网络药理学数据挖掘、分子对接与体内外实验验证技术服务
网络药理学是融合系统生物学、生物信息学、网络科学等学科,从系统层次和生物网络的整体角度出发,解析药物与治疗对象之间的分子关联,揭示药物的系统性药理机制,从而指导新药研发和临床治疗,是人工智能和大数据时代药物系统性研究的新兴学科。网络药理学的研究流程如下:
(1)通过在线中药化学成分数据库获取中药复方或单味中药的化学成分,然后通过公共数据库(如SwissTarget Prediction、PharmMapper数据库等)或高通量测序/组学的数据对各成分相应的蛋白靶点进行预测。
(2)通过疾病数据库(OMIM数据库、Genecards数据库、DrugBank数据库等)或者TCGA/GEO获取疾病的靶点信息或者疾病中差异表达的基因,将中药各成分对应的靶点和疾病对应的靶点取交集即为中药成分治疗疾病的潜在作用靶点。
(3)采用Cytoscape构建成分-靶点、靶点-相关互作蛋白的网络进行网络拓扑分析,并利用生物信息学软件将潜在作用靶点进行GO、KEGG富集分析,初步揭示中药复方/单味中药/中药单体的作用机制,最后利用分子对接和体内外实验进行验证。
图片来源:JIANG Ruohong, WEN Xiangyue, ZHANG Yaming, LU Xuehua, XU Xiaomei, LI Lisha, XU Rongqing, LIN Wenjin*. Molecular mechanism and rule of TCM prescriptions containing Alismatis Rhizoma in the clinical treatment of hyperlipidemia based on data mining and network pharmacology.Journal of Holistic Integrative Pharmacy.2022, 3(4):346-363
为满足部分临床医药工作者课题申报缺乏研究工作基础的需求,药物所新推出“网络药理学数据挖掘与体内外实验(大小鼠、斑马鱼、细胞等)验证技术服务",协助解决临床医药工作者课题研究工作。竭诚欢迎省内外医药科研工作者咨询! 联系电话:0591-87514999